05/05/2021
0ВПЕРВЫЕ СЕКВЕНИРОВАН ВЕСЬ ГЕНОМ ЕНОТОВИДНОЙ СОБАКИ – ИССЛЕДОВАТЕЛИ ВИДЯТ ВОЗМОЖНОСТЬ ПЕРЕДАЧИ SARS-COV-2
На фото: Енотовидная собака (Nyctereutes procyonoides) родом т из Восточной Азии и в настоящее время встречается во многих европейских странах. Внешне она похож на енота. (Фото: Дориан Д. Дёрге, Университет Гете, Франкфурт)
Исследователи из Центра трансляционной геномики биоразнообразия (TBG) LOEWE впервые секвенировали весь геном енотовидной собаки и обнаружили генетические доказательства того, что она может передавать SARS-CoV-2. Родственник лисы, который происходит из Восточной Азии, широко распространился в Европе и классифицируется как инвазивный вид в Германии. Хорошо известно, что он может переносить различные вирусы и заражать ими людей. Исследование предполагает, что енотовидная собака также может быть резервуаром для коронавирусов. Статья опубликована в специализированном журнале «Границы генетики».
«Енотовидная собака переносит множество болезней, которые опасны для людей, их домашних и сельскохозяйственных животных. К ним относятся бешенство, чумка и лисий цепень », – говорит проф. Свен Климпель из LOEWE Center TBG , Зенкенбергского центра исследований биоразнообразия и климата (SBiK-F) и профессор паразитологии и биологии инфекций Франкфуртского университета Гете . «Енотовидная собака, пришедшая из Азии, теперь встречается во многих частях Европы и, вероятно, будет продолжать распространяться. В его геноме мы находим указания на роль, которую он играет в передаче SARS-CoV-2 ».
Генетический материал, который находится в форме ДНК в ядре клетки, был получен группой исследователей Климпеля из образцов крови и тканей животных. Геном енотовидной собаки состоит из 2,39 миллиарда единиц, называемых парами оснований. Лабораторные тесты и обширный анализ с использованием высокопроизводительных компьютеров в LOEWE Center TBG показали, какой ген можно найти в этом огромном количестве данных и какой белок из него производится.
«В геноме енотовидной собаки мы обнаружили гены двух мембранных белков, к которым может пристыковаться SARS-CoV-2», – говорит молекулярный эколог проф. Маркус Пфеннингер из LOEWE Center TBG и SBiK-F. «Они составляют генетическую основу для заражения енотовидных собаками коронавируса и их передачи». Данные также показывают, что один из мембранных белков енотовидной собаки связывается со шиповым белком SARS-CoV-2 с большей аффинностью, чем у родственников енотовидных собак, таких как лисы и волки или летучие мыши и азиатские ящеры.
«До сих пор в центре внимания были летучие мыши и ящеры как потенциальные прямые переносчики SARS-CoV-2 на людей», – говорит Климпель. «От какого животного-хозяина коронавирус в конечном итоге передался человеку, пока неясно. Однако наше исследование показывает, что енотовидная собака тоже может выступать в качестве подходящего резервуарного хозяина, – переносщика короновируса».
Енотовидные собаки ( Nyctereutes procyonoides ) относятся к семейству собак и тесно связаны с лисами. Внешне всеядные животные напоминают енотов. Представленные как охотничьи и пушные звери, енотовидные собаки распространились по Европе в 20 веке. Как конкуренты или хищники, они могут поставить под угрозу популяции местных животных, например птиц, которые размножаются на земле. Как переносчики болезней, они могут представлять опасность для здоровья людей, находящихся в тесном контакте с животными. Климпель исследует такие эффекты в рамках проекта « Зоонозные и экологические эффекты инвазивных плотоядных животных», сокращенно ZOWIAC, Общества исследований природы Зенкенберга и Франкфуртского университета им. Гете.
«Секвенирование генома енотовидной собаки – это только начало», – объясняет Климпель. «Теперь мы можем более точно проанализировать, как отдельные гены связаны с передачей определенных заболеваний. Наши данные также могут помочь лучше понять племенную историю собак. Например, до сих пор неясно, почему енотовидная собака – единственная собака, впадающая в спячку ». Чтобы получить ответы на как можно большее количество исследовательских вопросов, исследователи TBG делают свои данные общедоступными, в том числе в базе данных Европейского архива нуклеотидов ( ENA) .
Публикация:
Луис Дж. Чуэка, Джудит Кохманн, Тилман Шелл, Карола Грев, Аксель Янке, Маркус Пфеннингер, Свен Климпель: «De novo сборка генома енотовидной собаки ( Nyctereutes procyonoides ) » Границы генетики, том 12/2021
DOI: 10.3389 /fgene.2021.658256
ISSN: 1664-8021
Источник: Центр трансляционной геномики биоразнообразия LOEWE, 4 мая 2021 г., Франкфурт.
